Solution home | Dawaco Ecologie | Werken met Dawaco Ecologie

Dawaco Ecologie - Module Aquo-kit

Modified on: Fri, 17 Dec, 2021 at 11:06 AM

Voor de opleiding van gebruikers van het informatiesysteem voor meetnetten Dawaco – Ecologie is trainingsmateriaal ontwikkeld. Net zoals de applicatie is het trainingsmateriaal georganiseerd per module.

In de serie “Werken met Dawaco” zijn beschikbaar:

• Algemeen
• Chemie
• Biologie
• Meetplanbeheer
• Aquo-kit
• Koppeling met ArcGis Online

Deze sectie beschrijft het werken met de module Aquo-kit voor de versies 2014c en 2017 van Dawaco-Ecologie.

U kunt dit document ook als PDF downloaden. Zie de sectieDownloads onderaan deze pagina

Onderwerpen

• Inleiding
  • Aquo-kit
  • Versies 2014c en 2017
  • Opbouw van het document
• Exportbestanden
  • Inleiding
  • Meetpuntenbestand
  • Monsterbestand
  • Metingenbestand - Chemie
  • Metingenbestand - Biologie
• Chemie
  • Aquo-kit codering parameters in versie 2014c
  • Aquo-kit codering parameters in versie 2014c
• Kenmerken
  • Inleiding
  • Exportbestand - Metingen
  • Exportbestand - Monsters
  • Exportbestand - Metingen
• Export/import – Aquo Kit
  • Inleiding
  • Instellingen chemie
  • Instellingen biologie
  • Instellingen biologie – bemonsteringsmethoden
  • Instellingen biologie – kenmerken
  • Export – chemie
  • Export biologie
• Werkprocedure
  • Werkprocedure chemie
• Downloads

Inleiding

Aquo-kit

Voor de toetsing van chemische en biologische monsters heeft het Informatie Huis Water (IHW) de Aquo-kit ontwikkeld. De module Aquo-kit faciliteert de export van gegevens uit Dawaco – Ecologie in het door de Aquo-kit vereiste formaat.

Versies 2014c en 2017

In eerste instantie is de module Aquo-kit ontwikkeld voor versie 2017. Door de tijddruk vanuit IHW is door Royal HaskoningDHV gekozen om de module Aquo-kit versneld uit te brengen in versie 2014c. Voor deze versie is geen conversie noodzakelijk wat wel het geval is voor versie 2017. In de laatste versie is het compartiment toegevoegd aan zowel de biologische als chemische monsters.

Opbouw van het document

Dit document is als volgt opgebouwd:

• Exportbestanden In dit hoofdstuk worden de exportbestanden beschreven. Per kolom is aangegeven waar Dawaco de benodigde informatie “vandaan haalt”.
• Chemie De parametercodering in het exportbestanden moeten aangeboden worden volgens de um-aquo codering. In dit hoofdstuk wordt beschreven waar deze codering wordt ingevoerd in Dawaco.
• Kenmerken Een deel van de benodigde gegevens wordt binnen Dawaco opgeslagen in de kenmerken van meetpunt en biologische monsters. Dit hoofdstuk beschrijft de definitie van deze kenmerken.
• Export/Import aquo-kit De menuoptie Export/Import – Aquo-kit is uitgerust met 4 tabs voor de 2014c versie en 6 tabs voor de 2017 versie. De functionaliteit van de tabs maken het mogelijk allerlei instellingen uit te voeren en de daadwerkelijke export uit te voeren. De import van de Aquo-kit resultaten is ondergebracht in versie 2017 en heeft ook een instellingen tab.
• Werkprocedure Een stappenplan voor de versies 2014c en 2017 is ondergebracht in dit hoofdstuk. Het stappenplan is gespecificeerd voor de chemie en biologie. In het stappenplan is zijn de uit te voeren stappen in detail beschreven.

[Terug naar begin]

Exportbestanden

Inleiding

De export ten behoeve van de Aquo-kit wordt verdeeld over 3 bestanden: meetpunten, monsters (alleen voor taxontype Vissen) en metingen. In dit hoofdstuk worden de bestanden beschreven inclusief de herkomst van de informatie binnen Dawaco.

De herkomst kent de volgende bronnen:

• Veld Een veld van een bestand: bijvoorbeeld x-coördinaat van het meetpunt
• Meetpuntkenmerk De waarde van een meetpuntkenmerk
• Monsterkenmerk De waarde van een biologisch monsterkenmerk
• Instelling De waarde van een instelling zoals vastgelegd in een tab van menuoptie Import/Export Aquo-kit
• Vast Vaste waarde vastgelegd in de programmatuur
• NVT Veld is niet van toepassing

Meetpuntenbestand

Het bestand bevat de meetpuntinformatie en wordt door Dawaco geschreven in de dump-folder onder de naam Aquokit_v#_meetpunten.csv.

In onderstaande tabel zijn de kolomtitels en de bron van de gegevens weergegeven.

Opmerkingen:

• KRWwatertype.code De binnen Dawaco gebruikte voorloop 0 wordt in de export verwijderd (R04 wordt R4).

Monsterbestand

Het bestand wordt alleen geschreven bij de export van visgegevens, bevat de monsterinformatie en wordt door Dawaco geschreven in de dump-folder onder de naam Aquokit_v#_monsters.csv.

In onderstaande tabel zijn de kolomtitels en de bron van de gegevens weergegeven.

Opmerkingen:

• Monsternemingsdatum De datum wordt geschreven in de militaire notatie yyyy-mm-dd
• Bemonsteringsapparaat.code De klasse van het kenmerk voor het vangstuig wordt overgezet naar de ingestelde waarde voor het bemonsteringsapparaat.

Metingenbestand - Chemie

Het bestand wordt alleen geschreven bij de export van visgegevens, bevat de monsterinformatie en wordt door Dawaco geschreven in de dump-folder onder de naam Aquokit_v#_metingen.csv.

In onderstaande tabel zijn de kolomtitels en de bron van de gegevens weergegeven.

Opmerkingen:

• Datums

De datums worden geschreven in militair formaat (yyyy-mm-dd)

• Tijd

De tijden worden geschreven als uu:mm:ss. De seconden worden tijdens de export toegevoegd.

Metingenbestand - Biologie

Het bestand wordt alleen geschreven bij de export van visgegevens, bevat de monsterinformatie en wordt door Dawaco geschreven in de dump-folder onder de naam Aquokit_v#_metingen.csv.

In onderstaande tabel zijn de kolomtitels en de bron van de gegevens weergegeven.

Opmerkingen:

• Datums

De datums worden geschreven in militair formaat (yyyy-mm-dd)

• Tijd

De tijden worden geschreven als uu:mm:ss. De seconden worden tijdens de export toegevoegd.

• Chemische parameters zoals chlorofyl, chloride en calcium worden afgehandeld als een chemie export (zie voorgaande paragraaf)
• Kenmerken

De kolommen Grootheid.code, Parameter.code, Parameter.omschrijving en Eenheid.code worden overgenomen uit de instellingen (tab: Instellingen – Kenmerken).

• Waardebepalingsmethode.code

De waarde bepalingsmethode wordt overgenomen uit de instellingen kenmerken tenzij een andere waarde is ondergebracht in een monsterkenmerk.

• LengteKlasse.code

Geldt alleen voor Vis met type invoer 5 (stadia numeriek). Het stadium 5 wordt voorafgegaan door ‘VL’ en gevolgd door ‘cm’ (stadium ‘5’ wordt: ‘VL 5cm’).

[Terug naar begin]

Chemie

Aquo-kit codering parameters in versie 2014c

In versie 2014c is de um-aquo codering van de parameters ondergebracht in menuoptie: Invoer – Chemie – Tab: Parameters. In onderstaande figuur is het scherm weergegeven.

Figuur 1: Invoerscherm parametercodering versie 2014c

Aquo-kit codering parameters in versie 2017

In versie 2017 is de um-aquo codering van de parameters ondergebracht in menuoptie: Invoer – Chemie – Tab: Parameters. In onderstaande figuur is het scherm weergegeven.

Figuur 2: Invoerscherm parametercodering versie 2017

[Terug naar begin]

Kenmerken

Inleiding

Voor een aantal kolommen in de exportbestanden zijn de waarden vastgelegd in kenmerken. In dit hoofdstuk zijn de benodigde kenmerken met een voorzet voor de naam weergegeven.

Exportbestand - Metingen

Voor het exportbestand METINGEN zijn de volgende meetpuntkenmerken noodzakelijk:

Exportbestand - Monsters

Voor het exportbestand MONSTERS zijn de volgende monsterkenmerken noodzakelijk voor het taxontype VISSN

Bemonsteringsapparaat.code

Het bemonsteringsapparaat of vangtuig kan het beste gedefinieerd worden als een multiple-choise kenmerk met alleen die klassen, die invloed hebben op de berekening. Voorstel:

1. Stortkuil
2. Zegen
3. Zegen met keernetten
4. Electrisch schepnet met keernetten
5. Electrisch schepnet

Exportbestand - Metingen

Voor het exportbestand METINGEN zijn per taxontype de volgende monsterkenmerken noodzakelijk. De kenmerken zijn gespecificeerd naar taxontype. Omdat de toekenning over verschillende kolommen loopt, zijn de kolommen in onderstaande tabel niet benoemd.

Waardebepalingsmethode.code

De waardebepalingsmethode (kolom AI van het METINGEN bestand) kent een default per taxontype:

Bij afwijkende waardebepalingsmethoden kan de gewenste waarde ondergebracht worden in een monsterkenmerk van het type tekst (bijvoorbeeld: AK_WB).

[Terug naar begin]

Export/import – Aquo Kit

Inleiding

De menuoptie Import/Export – Aquokit bevat de functionaliteit voor het exporteren van chemische en biologische gegevens in het verplicht formaat, maar ook de benodigde instellingen voor de koppeling van de in Dawaco opgeslagen informatie aan de kolommen van de exportbestanden. De menuoptie kent de volgende tabs:

• Export

Aanmaken van de chemische en biologische exportbestanden, die kunnen worden ge-upload naar de IHE site.

• Import

De import van de toetsingsresultaten in Dawaco (alleen in versie 2017).

• Instellingen bemonsteringsmethoden

De grootheid, hoedanigheid, eenheid en het biologische compartiment van de biologische gegevens is gekoppeld aan de bemonsteringsmethoden. Het compartiment vervalt in versie 2017, omdat het compartiment in versie 2017 een eigenschap van het monster is.

• Instellingen kenmerken

In het hoofdstuk kenmerken zijn de benodigde kenmerken besproken. In deze tab worden de kenmerken en de benodigde chemische parameters, chlorofyl-a, chloride en calcium, gekoppeld aan de kolommen van de exportbestanden. Ook kan de Namespace, de code van het waterschap, hier worden opgegeven.

• Instellingen taxa

Als de TWN lijst niet volledig wordt gevolgd, dan kan een vertaal tabel voor de taxa worden opgesteld met behulp van deze tab. Dawaco benamingen voor de taxa worden tijdens de export vertaald met behulp van deze tabel. Gebruikers die de TWN lijst wel volledig hanteren, hoeven deze tab niet te gebruiken.

• Instellingen import

In de 2017 versie wordt het mogelijk om de toetsingsresultaten als meetpunt- of monsterkenmerk te importeren. De tab biedt de functionaliteit om de toetsingsresultaten te koppelen aan de kenmerken. De feitelijke import van de toetsingsresultaten is ondergebracht in de tab import.

Instellingen chemie

Voor de chemie is alleen de instelling van de Namespace en meetpuntkenmerken voor de geo-object nodig. Die zijn ondergebracht in de tab Instellingen – kenmerken. Als er nog geen parametergroep beschikbaar is met de te exporteren parameters, dan moet deze worden aangemaakt. Verondersteld wordt dat voor de parameters de um-aquo gegevens ingevoerd zijn. Opgemerkt wordt dat in versie 2014c alleen de metingen van het compartiment oppervlakte water kunnen worden geëxporteerd.

Instellingen biologie

Voor de biologie zijn meer instellingen nodig. Deze zijn ondergebracht in de tabs Instellingen bemonsteringsmethoden, kenmerken en taxa.

Instellingen biologie – bemonsteringsmethoden

Voor het bestand METINGENis de informatie voor de kolommen:

• Grootheid.code (kolom O),
• Hoedanigheid.code (kolom T),
• Eenheid.code (kolom Y) en
• Compartiment.code (kolom U),

gekoppeld aan de bemonsteringsmethoden. In versie 2017 vervalt de impliciete koppeling van het compartiment. De koppeling wordt ingesteld in menuoptie: Import/Export – Aquokit – Tab: Instellingen – Bemonsteringsmethoden. In onderstaande figuur is het scherm weergegeven.

Figuur 3: Koppelen van aquokit informatie aan bemonsteringsmethoden

Werkwijze:

• Dawaco toont alle beschikbare bemonsteringsmethoden.
• Vul voor de methoden, die opgenomen mogen worden in de export, de gewenste Aquokit informatie toe. De kolommen zijn voorzien van zoeklijsten.
• Bewaar de informatie nadat alle gewenste informatie is ingevoerd.

Opmerkingen:

• De resultaten worden bewaard in het bestand Configfolder\Aquokit_Bm.csv.
• De zoeklijsten zijn vastgelegd in de bestanden Configfolder\Aquokit_Bm_veld.csv. De gebruiker mag hieraan op eigen risico codes toevoegen.

Instellingen biologie – kenmerken

In het hoofdstuk over de kenmerken is de benodigde lijst met kenmerken besproken. In deze paragraaf vindt de koppeling van de kenmerken (en chemische parameters) aan de kolommen van de exportbestanden besproken.

De tab kent de volgende groepen:

• Algemeen
• Fytoplankton
• Macrofyten
• Diatomeeën
• Macrofauna
• Vissen

Algemeen

Het scherm van de groep is weergegeven in onderstaande figuur.

Figuur 4: Scherm algemene instellingen – Groep: Algemeen

Opmerkingen

• De Namespace is voor biologie en chemie verplicht.
• Waardebepalingsmethode
• De waarde bepalingsmethode is alleen noodzakelijk als deze afwijkt van de eronder weergegeven defaultwaarden.

Groep: Fytoplankton

Voor de groep fytoplankton hoeft alleen het parameternummer voor chlorofyl te worden opgegeven. Als de module chemie niet in gebruik is, dan kan de gebruiker de waarde voor chlorofyl onderbrengen in een monsterkenmerk. Voor bron wordt dan MK geselecteerd in plaats van FC.

Groep: Macrofyten

Bij de macrofyten gaat het om de koppeling van de kenmerken, die de bedekkingsgraden, lengtefracties en breedtes bevatten. Niet alle aquo parameters behoeven te worden voorzien van een Dawaco kenmerk.

Groep: Diatomeeën

Voor de beoordeling van KRW-type R1 en R2 is de concentratie van calcium nodig. De fysisch/chemische parameter voor calcium kan hier worden vastgelegd. Als in het verzorgingsgebied geen bronnen voorkomen, dan is de instelling niet noodzakelijk. Net zoals voor chlorofyl mag de waarde als monsterkenmerk worden aangemaakt.

Groep: Macrofauna

Voor macrofauna moet de parameter voor chloride worden vastgelegd als in het verzorgingsgebied KRW-type M30 voorkomt. Daarnaast zijn de koppeling van de kenmerken voor het bemonsteringsoppervlak en de monsterwegingsfactor mogelijk.

Groep: Vissen

Uiteraard zijn de instellingen voor de groep Vissen wat ingewikkelder. Figuur 6 toont het scherm.

Figuur 6: Instellingen voor vissen

In Dawaco is een meer veelal ondergebracht in een meetpunt. De verschillende trajecten worden ondergebracht in monsters. De totale oppervlakte, het beviste oppervlak van het traject (monster), de visvangstfactor (zie documentatie van het IHW) en de optionele coördinaten van de start van het traject zijn ondergebracht in monsterkenmerken. Dus ook het totale oppervlak!

Bij rivieren en sloten is het meetpunt de locatie van de bevissing en het monster bevat de resultaten..

Vistuig

Er zijn ongeveer 20 vistuigen gecodeerd, waarvan er maar 5 invloed worden gebruikt tijdens de toetsing. Deze zijn ondergebracht in de klassen van het multiple choice kenmerk voor vistuig. De klassen worden gekoppeld aan de vistuigcodes van het IHW.

Export – chemie

Selectieprocedure

De procedure bestaat uit:

• de meetpuntselectie
• de periodeselectie
• de compartimentselectie (versie 2017)
• parametergroep selectie

Opgemerkt wordt, dat de bestandsnaam een .csv extensie moet hebben (default is aquokit_v1.csv). Voor het meetpunten, monster en metingen bestand worden deze termen ingevoegd. De opgegeven bestandsnaam aquokit_v1.csv levert daardoor de bestanden:

• Aquokit_v1_meetpunten.csv
• Aquokit_v1_monsters.csv (alleen bij vis)
• Aquokit_v1_metingen.csv

De bestanden mogen ter inspectie wel geopend worden in Excel, maar het aanpassen wordt afgeraden omdat Excel het formaat van datums (militaire formaat) en getallen (decimaal teken) ongewenst wijzigt. Notepad of Wordpad kent dit bezwaar niet.

Export biologie

Selectieprocedure

De procedure bestaat uit:

• de meetpuntselectie
• de periodeselectie
• de compartimentselectie (versie 2017)
• gewenste bemonsteringsmethoden

De lijst met bemonsteringsmethoden bevat alleen de methoden, die voorzien zijn van een grootheid, hoedanigheid en eenheid (zie instellingen bemonsteringsmethoden).

Opgemerkt wordt, dat de bestandsnaam een .csv extensie moet hebben (default is aquokit_v1.csv). Voor het meetpunten, monster en metingen bestand worden deze termen ingevoegd. De opgegeven bestandsnaam aquokit_v1.csv levert daardoor de bestanden:

• Aquokit_v1_meetpunten.csv
• Aquokit_v1_monsters.csv (alleen bij vis) en
• Aquokit_v1_metingen.csv

De bestanden mogen ter inspectie wel geopend worden in Excel, maar het aanpassen wordt afgeraden omdat Excel het formaat van datums (militaire formaat) en getallen (decimaal teken) ongewenst wijzigt. Notepad of Wordpad kent dit bezwaar niet.

[Terug naar begin]

Werkprocedure

In dit hoofdstuk wordt een mogelijke werkprocedure voor chemie en biologie gepresenteerd.

Werkprocedure chemie

De werkprocedure kent de volgende stappen

• Aanmaken meetpuntkenmerken
• Toekennen van de waarden aan de meetpuntkenmerken
• Aanmaken parametergroep
• Instellen aquokit
• Exporteren gegevens

Aanmaken meetpuntkenmerken

• De meetpuntkenmerken worden meegeleverd in het bestand MPKMDEF.CSV.
• Pas dit bestand indien gewenst aan.
• Importeer het bestand vervolgens met menuoptie: Invoer – Meetpunten – Kenmerkdefinitie.

Toekennen van de waarden aan de meetpuntkenmerken

• Maak een export van de gewenste meetpunten met bijvoorbeeld Uitvoer – Meetpunten - Optie Tabel meetpunten.
• Verwijder in Excel alle kolommen met uitzondering van de kolom Mp.
• Voeg hier aan toe de kolommen Kenmerk en Waarde.
• Vul per meetpunt de kolommen Kenmerk en Waarde met de juiste informatie.
• Importeer de kenmerken met menuoptie: Import/Export – Meetpunten – Tab: Kenmerken-Lijst.
  • Chemie – 2014c
  • Biologie – 2014c
  • Chemie – 2017
  • Biologie - 2017

[Terug naar begin]